Los fines de la Fundación, según el artículo 5 de los Estatutos, son los siguientes:
Atender a la difusión y fomento de los valores espirituales, religiosos, culturales, artísticos o históricos que estén directamente relacionados con el Monasterio de Santo Domingo de Silos o con la comunidad religiosa que lo rige o que puedan favorecer la consideración de aquél como lugar de encuentro de pensamientos e ideas en estos ámbitos. Además, atenderá a la difusión y fomento del entorno geográfico y cultural, presente o pasado del Monasterio, y en general, a la difusión y fomento de las artes y la cultura.
Podrá asimismo, dirigir su actividad a la conservación y restauración de inmuebles y objetos muebles de interés cultural, artístico o histórico, patrimonio documental y bibliográfico, yacimientos o zonas arqueológicas.
En el ejercicio de sus misiones, la Fundación podrá conceder premios y becas para artistas e investigadores; celebrar actos, organizar exposiciones, conciertos, cursos y seminarios; crear museos, bibliotecas, y, en general, establecimientos culturales y Centros docentes y de investigación; editar publicaciones, concertar acuerdos e intercambios con Universidades, Instituciones y Centros españoles y extranjeros.